Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms