Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms