Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Kdm4dQ3U2K5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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