Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms