Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms