Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms