Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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