Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2cQ3TLH4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms