Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim63Q38HM4 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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