Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms