Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms