Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms