Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms