Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms