Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Sh3bp2Q06649 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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