Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms