Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms