Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col1a2Q01149 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms