Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms