Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms