Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb1Q00420 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms