Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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