Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms