Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx2P81066 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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