Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp3P63024 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms