Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms