Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms