Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppfia3P60469 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms