Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms