Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rrp1P56183 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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