Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rad23aP54726 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rad23aP54726 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rad23aP54726 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rad23aP54726 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rad23aP54726 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rad23aP54726 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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