Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Defa11P50709 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Defa11P50709 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Defa11P50709 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa11P50709 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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