Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbrP50284 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbrP50284 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms