Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms