Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ptk2P34152 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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