Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms