Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RxrbP28704 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrbP28704 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrbP28704 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrbP28704 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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