Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dusp1P28563 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms