Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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