Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tsta3P23591 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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