Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VimP20152 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VimP20152 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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