Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18528 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18528 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
P18528 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms