Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcna3P16390 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms