Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FosbP13346 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FosbP13346 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FosbP13346 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FosbP13346 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms