Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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P10404 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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P10404 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P10404 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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