Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb4P10284 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms