Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Becn2P0DM65 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms