Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms