Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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