Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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